Diretor de cinema, escritor e cineasta. Ele é conhecido por escrever e dirigir o filme 2009 Sin Nombre, o filme 2011 Jane Eyre e pela direção e produção executiva da primeira temporada da série da HBO True Detective, pelo qual ganhou o prêmio Emmy de Melhor Diretor de Série Dramática. Ele tem recebido elogios do drama de guerra Beasts of No Nation, em que Fukunaga era escritor, diretor, produtor e diretor de fotografia.

Fukunaga nasceu em Oakland, Califórnia, filho de um pai japonês-americano de terceira geração, Anthony Shuzo Fukunaga, nascido em um campo de internamento japoneses durante a Segunda Guerra Mundial, que trabalhava para uma empresa gerador e depois para a Universidade de Califórnia, Berkeley; e uma mãe sueca-americana, Gretchen Maio Grufman, que trabalhou como um higienista dental e mais tarde como um professor de história. Seus pais se divorciaram.
Fukunaga disse que seus tios e tias são todos professores do ensino fundamental ou cientistas.

Fukunaga originalmente queria ser um snowboarder profissional, mas mudou para produção de filmes em seus vinte e poucos anos. Ele começou sua carreira como estagiário de câmera e depois na escola de cinema. Ele se formou na Universidade da Califórnia, Santa Cruz como um Bachelor of Arts da história em 1999, e participou do Instituto de Estudos Políticos (IEP) de Grenoble. Ele se matriculou na Escola Tisch do Programa de Pós-Graduação Film Arts da Universidade de New York.

Fukunaga vive em New York City. Já viveu na França, no Japão, e Cidade do México. Ele é fluente em francês e espanhol.