Instituto Alien é a segunda temporada do anime Super Onze. Estreando em dezembro de 2008, narra a história do time Raimon para se tornarem o melhor time de futebol de todos, mas antes disso eles tem a difícil missão de derrotar o Instituto Alien, uma escola formada por Extraterrestres que pretendem dominar a Terra. Nessa temporada, novas escolas e antigos colégios acaba tendo outros novos integrantes na Raimon.
1º Temporada é referente aos episódios 27 ao 54.