Blame! é um animê de seis curtos episódios com menos de cinco minutos. Há também um episódio que serve de introdução. O enredo se passa em um mundo futurístico, no qual a humanidade foi dizimada por uma doença genética e Killy, o protagonista, sai em busca de um ser humano geneticamente puro. Neste futuro pós-apocalíptico, a terra está enterrado em uma megaestrutura enorme criada por máquinas. Não há apenas um traço de humanidade e os seres de silício são criados de forma desenfreada. A última esperança para a humanidade é a informação em um disco de dados de um engenheiro chamado "Cibo".