A estória começa em Dezembro de 2199, quando as ruas estão cheias de expectativas para o fim do ano e o começo de um ano novo. Entre as celebrações, corre o boato de que Ragna the Bloodedge, um rebelde Classe SS que possui a maior recompensa por sua cabeça, apareceu na 13ª Cidade Hierárquica de Kagutsuchi. O alvo aparente de Ragna ou o "Ceifador" é a destruição do sistema que controla o mundo. Para receber a recompensa, um grupo variado de lutadores incomparáveis partem para Kagutsuchi.