A história principal da “Parte 1” do jogo, que mais tarde recebeu o título de “Observer on Timeless Temple”, consiste em sete capítulos e sete etapas da história humana. É parte de um mundo ramificado resultante de uma linha do tempo dividida antes da história da “Torre do Relógio 2015” devido às ações de Lev Lainur Flauros. Se ele terminar sua vida como no “Clock Tower 2015” original, o mundo continuará normalmente, mas Fate / Grand Order acaba por não cometer suicídio.

A história narra os esforços da Organização de Segurança da Caldéia para restaurar o senso comum do homem, extirpando o Santo Graal que sustenta singularidades cronológicas que interrompem a continuidade da história humana e contribuem para a Incineração da Ordem Humana. Isso é conhecido como a Grande Ordem, “a maior das Guerras do Santo Graal”.