O tema dessa vez será uma história de romance galáctica, reunindo amor, amizade e o destino do planeta. Assim como as séries passadas, ele vai trazer muita ação de mecha e triângulo amoroso. E o ponto forte dessa vez será a canção e dois ídolos que serão as heroínas do anime.
Macross Frontier é a história de uma frota colonial espacial tentando encontrar um planeta habitável perto do centro da Via Láctea . A história se concentra em três jovens adultos (uma cantora pop famosa, um piloto militar privado, e um cantora pop iniciante) e os eventos que ocorrem ao seu redor como a frota enfrenta uma crise contra os alienígenas Vajra.