Asagiri Aya é uma jovem que sofre bullying pesado na escola e em casa. Procurando uma maneira de escapar de seus problemas, ela se distrai na internet, quando aparece um misterioso site chamado "Mahou Shoujo Site". Só de olhar para a página faz Aya entrar no mundo mortal de Magical girl Apocalypse. Nesse lugar é matar ou morrer contra uma série de inúmeras máquinas assassinas, cada uma delas armada com poderes mágicos e uma sede insaciável de sangue e caos.