Uma jornalista estrangeira chega em uma pequena ilha do Pacífico a 200 milhas do largo da costa da América do Sul. Uma vez uma colônia de leprosos, a ilha foi mais tarde transformada em uma prisão e, em seguida, sob requisição da ONU, transformada em uma república independente. No entanto, apesar das estruturas democráticas, os habitantes - que falam um dialeto estranho composto de Espanhol e Inglês - ainda obedecem às regras da prisão.
A Colônia Penal é um documento poderoso das tensões e contradições do Chile nos precedentes à vitória eleitoral de Allende.